南通市婦幼保健院生殖醫學中心成立于2000年，中心發揚團隊精神，依托醫院實力，在臨床、教學、科研方面形成了獨特的技術體系。率先在蘇中、蘇北地區開展人工授精術，體外受精-胚胎移植、單精子卵胞漿內注射、胚胎玻璃化冷凍、囊胚培養、冷凍胚胎移植、胚胎輔助孵出、精子冷凍、卵子冷凍、時差攝影等輔助生殖衍生技術。婦科還開展各類宮腔鏡手術、減胎術、囊腫穿刺等手術。男性科開展男科常規手術及顯微手術，及各類男科專科檢查。

2019年生殖醫學中心業務量明顯增加，年門診量達到6萬多人次。接受人工授精治療600余例，周期臨床妊娠率在14%左右。中心臨床、實驗室水平不斷提高，取卵周期數1000余例，移植周期數1200余例。臨床妊娠率穩定在68%左右，各項輔助生殖質控指標在全省名列前茅。

生殖醫學中心現有工作人員25名，臨床醫生13名，其中主任醫師2名，副主任醫師4名，主治醫師4名，住院醫師3名。實驗室團隊6名，主任技師1名，副主任技師2名，主管技術2名，技師1名。護理團隊6名：副主任護師2名，主管護師3名，護師1名。學歷：博士3人，碩士7人.

生殖醫學中心積極響應科技興院的號召，注重學科發展及人才培養。2018年開始與北京協和醫院、上海仁濟醫院男科簽訂長期合作協議。2020年與上海復旦大學附屬婦產科醫院朱曉勇團隊合作成立復發性流產診治中心。每月專家來院坐診、指導，針對疑難病例會診討論，以講座、沙龍等方式對學科前沿、科室管理等方面進行指導，提高臨床診療水平。

中心近三年共發表論文30余篇，其中SCI 8篇，中文核心4篇。開展科研9項，其中省級科研3項。

2018年生殖中心成立日間病房，常年開展宮腔鏡、男科各類手術。為患者帶來便利，減少患者經濟負擔，縮短品均住院日，帶來了一定的社會效益。在院部及科室十四五規劃中將加強男科的發展，以男科發展為入口，帶動醫院的泌尿外科的發展。