南通市遺傳與生殖醫學研究所（Nantong Institute of Genetics and Reproductive Medicine）是2016年經南通市機構編制委員會批準成立的科研機構。研究所隸屬于南通市婦幼保健院，其集科學研究、人才培養及技術轉化于一體，以提升婦女兒童的健康水平為宗旨，以遺傳學、生殖醫學、出生缺陷等婦女兒童疾病的研究為重點，針對各學科的重點和熱點領域開展創新性和應用性研究。研究所坐落于南通市產業技術研究院，實驗室建筑面積約900平方米，儀器設備總值逾1千萬元，其中包括激光共聚焦顯微鏡、流式細胞儀、倒置熒光顯微鏡、多功能凝膠成像儀、實時定量PCR儀以及多功能酶標儀等多種先進儀器和設備。遺傳與生殖醫學研究所同時作為南通市婦幼保健院的公共科研平臺，為全院的科研工作提供技術支撐，以全面提升醫院科研水平。

研究所采用PI（Principal Investigator）制管理方式，每個PI分別帶領一個科研團隊。研究所目前擁全職和兼職PI共10人，研究方向覆蓋腸道微生物與生殖健康、遺傳學、生殖醫學、臨床檢驗及產前診斷新技術、圍產期及兒童藥物臨床試驗、以及出生缺陷防控等學科。此外，研究所還配備專職科研人員8人。研究所共有高級職稱7人，具有博士學位人員7人；江蘇特聘醫學專家1人、江蘇省“333”高層次人才培養工程培養對象1人、南通市“226”高層次人才培養工程培養對象3人、南通市青年醫學人才2人、江蘇“衛生創新團隊”和“紫瑯英才”創新團隊各一個；現承擔國家自然科學基金面上項目2項、國家自然科學青年基金2項及其他省、市級科研項目十多項。