南通市婦幼保健院兒外科，是南通市重點建設專科，南通市醫學創新團隊，擁有專業技術人員15人，其中醫生團隊有主任醫師1名，副主任醫師2名，主治醫師2名，住院醫師2名。兒外科由小兒普通外科、小兒泌尿外科、小兒矯形外科及新生兒外科等專業組成完整的專業體系，專業劃分精細，充分體現出專科專業的特色。主要治療0-18周歲兒童外科疾病，包括先天畸形，發育異常，小兒腫瘤，外科感染及創傷等。科室有4名成員在國家級學術團體任職，2人在學術雜志擔任編委。科室發表SCI及中文期刊論文30余篇，引進省市級醫療新技術近10項，開展各級科研項目6余項，開展國家級繼續教育項近2項。

新生兒外科、微創外科、矯形外科是科室的特色專業，也是科室的重點發展方向。科室引進無瘢痕手術技術（Scarless surgery），無血外科技術（Bloodless surgery technique）， 微創手術技術（Minimally invasive surgery），腹腔鏡手術技術（Laparoscopic surgery）等特色技術，適應小兒特別是新生兒組織器官嬌嫩，發育尚未成熟的特點，獲得良好效果。